Fakülte, Altyapı Mühendisliği alanında 1,5 yıl süren ve iki uzmanlık alanını kapsayan kapsamlı bir yüksek lisans programı sunmaktadır: Karayolu ve Demiryolu Mühendisliği Uzmanlığı ile Su ve Hidro-Çevre Mühendisliği Uzmanlığı. Karayolu ve Demiryolu Mühendisliği Uzmanlığı, öğrencileri ulaşım ağları, karayolu ve demiryolu yapıları ve tasarımı, akıllı ulaşım sistemleri ve ayrıca ulaşımın ekonomik ve yönetimsel yönleriyle ilgili ileri düzey bilgilerle donatır. Su ve Hidro-Çevre Mühendisliği Uzmanlığının temel amacı ise su ve atık su arıtma, hidrosistem modelleme, hidromorfoloji, hidroenformatik, ekoloji ve su kalitesi izleme konularında gelişmiş bir anlayış sağlamaktır. Bu uzmanlık alanları, hem doktora programlarında doktora derecelerini takip eden araştırma odaklı öğrencilere hem de kendi alanlarında karmaşık altyapı zorluklarının üstesinden gelmeye ve inşaat prosedürlerini yenilemeye hazır yeni nesil mühendislik liderlerine hitap etmektedir.
