Pécs Üniversitesi Fen Fakültesi’nde yürütülen Kimya Yüksek Lisans programı, her yıl Eylül ayında başlayan ve dört yarıyıl süren bir program olup, eğitim dili İngilizcedir. Bu program, kimya, biyokimya, fizik veya eczacılık alanlarında lisans diplomasına sahip öğrenciler için tasarlanmıştır. Müfredat, İleri Matematik, Moleküler Biyoloji, Koordinasyon Kimyası, İleri Fizikokimya, Aletsel Analiz, Yüzey Kimyası, Çevre Teknolojisi ve daha fazlasını içermektedir. Program, dersler, seminerler ve pratik oturumları bir araya getirir. Son yarıyılda öğrenciler, diploma projesini tamamlayıp savunarak ve genel bir sınavı geçerek derecelerini alırlar.